Elektwoforèz jèl ka fèt nan yon oryantasyon orizontal oswa vètikal.Jèl orizontal yo anjeneral konpoze de yon matris agarose.Gwosè pò nan jèl sa yo depann de konsantrasyon konpozan chimik yo: porositë jèl agarose (100 a 500 nm dyamèt) yo pi gwo ak mwens inifòm konpare ak sa yo ki nan gelpores akrilamid (10 a 200 nm an dyamèt).Konparativman, molekil ADN ak RNA yo pi gwo pase yon fil lineyè nan pwoteyin, ki souvan denatire anvan, oswa pandan pwosesis sa a, ki fè yo pi fasil pou analize.Kidonk, molekil ADN ak RNA yo pi souvan kouri sou jèl agaroz (orizontal). Sistèm DYCP-31DN nou an se yon sistèm elektwoforèz orizontal.Aparèy depoze jèl modle sa a ka fè 4 diferan gwosè jèl pa plato jèl diferan.
